Nuestro laboratorio está interesado en determinar redes regulatorias génicas que controlan la respuesta de las plantas a la disponibilidad de nutrientes, así como su interacción con otros organismos como hongos. De manera de abordar nuestras preguntas de investigación, utilizamos aproximaciones que combinan el uso de datos ómicos, modelamiento de redes regulatorias génicas y validación experimental de estas redes utilizando herramientas de biología molecular en plantas modelo como Arabidopsis thaliana, así como en cultivos de interés agronómico como Solanum lycopersicum. Nuestras actuales líneas de investigación son:

Redes regulatorias génicas de la respuesta a nutrientes en plantas

Nutrientes como nitrógeno y azufre son clave para el crecimiento y desarrollo vegetal. Sin embargo, las plantas están frecuentemente expuestas a suelos con cantidades limitantes de nutrientes para su óptimo crecimiento. Actualmente se emplean grandes cantidades de fertilizantes para mantener la productividad de los cultivos, causando daños a los ecosistemas y al ambiente. De manera de proponer nuevas estrategias para ayudar a las plantas a enfrentar la limitación nutricional, es de suma relevancia el comprender como las plantas sensan y responden a los nutrientes. Utilizando aproximaciones ómicas y de biología de redes, estamos determinando reguladores de la expresión génica (factores de transcripción, factores epigenéticos, RNAs pequeños) que juegan papeles centrales en la respuesta a nutrientes en plantas.

Interacción interespecies entre plantas y hongos

Nuestro objetivo es determinar los mecanismos por los cuales las plantas responden al ambiente y cómo su interacción con otros organismos modula esta respuesta. Mientras que hongos patógenos pueden causar grandes pérdidas a los cultivos, otras interacciones entre hongos y plantas tienen un impacto positivo en el crecimiento, tolerancia a estrés y adquisición de nutrientes. En esta línea de investigación estamos llevando a cabo investigación fundamental y aplicada para 1. Determinar el papel de RNAs pequeños de plantas y hongos en la regulación de la expresión génica durante la comunicación entre especies. 2. Identificar especies fúngicas que promuevan el crecimiento vegetal en condiciones normales y estresantes. 3. Identificar comunidades fúngicas asociadas con la rizósfera de plantas que viven en condiciones extremas.

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Biografía

La Dra. Vidal obtuvo su Doctorado en Ciencias Biológicas en la P. Universidad Católica de Chile (PUC), trabajando con el Dr. Rodrigo Gutiérrez en la identificación de los componentes de RNAs pequeños y mRNAs del transcriptoma en respuesta a nitrato en Arabidopsis thaliana. Luego de finalizar su Doctorado, la Dra. Vidal trabajó como Investigadora Adjunta en el Departamento de Genética Molecular y Microbiología de la PUC, con el apoyo de un proyecto de inserción en la Academia (Proyecto Bicentenario de Ciencia y Tecnología). Como Investigadora Adjunta, lideró diferentes investigaciones relacionadas con la identificación de redes regulatorias génicas controladas por Nitrógeno en plantas. La Dra. Vidal se integra al Centro de Genómica y Bioinformática de la Universidad Mayor como Profesora Asistente en 2016, y es nombrada Directora del Centro el año 2019. La Dra. Vidal es actualmente Profesora Asociada de la U. Mayor, Investigadora Asociada del Instituto Milenio de Biología Integrativa iBio, Directora Alterna del Anillo ACT210007, y ha participado como Investigadora Responsable de diversos proyectos (FONDECYT 11121225, FONDECYT 1170926, FONDECYT 1211130, REDES180097, FONDEQUIP210208).

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Publicaciones seleccionadas

1. Contreras-López, O.+, Vidal, E.A.+, Riveras, E.+, Álvarez, J.M.+, Moyano, T.C.+, Sparks, E., Medina, J., Pasquino, A., Benfey, P.N., Coruzzi, G.M., Gutiérrez, R.A., 2022, Spatiotemporal analysis identifies ABF2 and ABF3 as key hubs of endodermal response to nitrate. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 119, e2107879119. +These authors contributed equally to this work
2. Olivares-Yañez, C., Sánchez, E., Pérez-Lara, G., Seguel, A., Camejo, P.Y., Larrondo, L.F., Vidal, E.A.*, Canessa, P.*, 2021, A comprehensive transcription factor and DNA-binding motif resource for the construction of gene regulatory networks in Botrytis cinerea and Trichoderma atroviride. Comput. Struct. Biotechnol. J. 19, 6212-6228. *Co-corresponding authors
3. Canales, J.*, Uribe, F., Henríquez-Valencia, C., Lovazzano, C., Medina, J., Vidal, E.A.*, 2020, Transcriptomic Analysis at Organ and Time Scale Reveals Gene Regulatory Networks Controlling the Sulfate Starvation Response of Solanum lycopersicum. BMC Plant Biol 20, 385. *Co-corresponding authors
4. Vidal, E.A., Moyano, T.C., Riveras, E., Contreras-López, O., Gutiérrez, R.A., 2013, Systems approaches map regulatory networks downstream of the auxin receptor AFB3 in the nitrate response of Arabidopsis thaliana roots. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 110(31):12840-5
5. Vidal, E.A., Araus, V., Lu, C., Parry, G., Green, P.J., Coruzzi, G.M., and Gutiérrez, R.A., 2010, Nitrate-responsive miR393/AFB3 regulatory module controls root system architecture in Arabidopsis thaliana. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 107, 4477-4482

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