Carolina Sánchez

Investigador Principal y Profesor Asistente

Advanced Genomics Laboratory

Doctora en Biotecnología, Universidad Técnica Federico Santa María y Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Chile.

carolina.sanchezd@umayor.cl

Líneas de Investigación

  • Secuenciación masiva paralela y su aplicación para investigación y diagnóstico clínico
  • Medicina de precisión y farmacogenómica

Advanced Genomics Laboratory

La investigación del Laboratorio de Genómica Avanzada se centra en la aplicación de los últimos desarrollos en secuenciación masiva de ADN para abordar preguntas importantes en temáticas de investigación básica, biología del genoma y salud. La mayoría de nuestros proyectos están directamente relacionados con la medicina traslacional que busca diagnósticos precisos, refinar terapias y mejorar los tratamientos y la calidad de vida para las personas afectadas por diferentes enfermedades. El laboratorio está constantemente trabajando en la implementación de nuevas aplicaciones de tecnologías de secuenciación de ADN, desarrollando protocolos y pruebas, y sistemas de automatización. Hemos establecido un paquete de herramientas eficaz para generar datos de la más alta calidad, mantener un tiempo de respuesta rápido para el de análisis los proyectos internos y colaborativos. Apoyamos a nuestros colaboradores en la preparación de muestras, el manejo de grandes cantidades de información, análisis bioinformáticos e interpretación de resultados.

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Biografía

Carolina Sánchez, PhD es profesora en la Universidad Mayor y directora del núcleo de secuenciación de ADN del Centro de Genómica y Bioinformática. Trabaja junto con Genoma Mayor (www.genomamayor.com) brindando servicios de genómica y bioinformática para investigadores locales, instituciones públicas o privadas de Chile y América Latina basadas en tecnologías de secuenciación de próxima generación. Recibió su licenciatura de la Universidad de Santiago, Chile y su doctorado en biotecnología de la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso y la Universidad Federico Santa María, Chile.

Las habilidades y la experiencia que ha desarrollado a lo largo de los años ahora se aplican al desarrollo y la adaptación de nuevas tecnologías para las rutinas de secuenciación de próxima generación y otras aplicaciones. También fue una contribuyente clave de los borradores publicados de genomas de varios organismos y participa en los Proyectos del Genoma Maqui.

Actualmente, la investigación de la Dra. Sánchez se centra en la aplicación de la secuenciación de próxima generación a la medicina genómica utilizando estos datos para apoyar la toma de decisiones terapéuticas. Además de esto, está a cargo de administrar y ejecutar el primer ensayo clínico en América Latina utilizando secuenciación de próxima generación para caracterizar muestras de cáncer de pulmón para el Centro de Excelencia en Medicina de Precisión de Pfizer.


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Publicaciones destacadas

MATAMALA, JM., ARIAS-CARRASCO, R., SÁNCHEZ, C., UHRIG, M., BARGSTED, L., MATUS, S., MARACAJA-COUTINHO, V., ABARZUA, S., VAN ZUNDERT, B., VERDUGO, R., MANQUE, P., HETZ, C. (2018) Genome-wide circulating microRNA expression profiling reveals potential biomarkers for amyotrophic lateral sclerosis. Neurobiology of Aging. 64:123–138.

CASTRO-NALLAR, E., VALENZUELA, SL., BAQUEDANO, S., SÁNCHEZ, C., FERNÁNDEZ, F., TROMBERT, AN. (2017) Draft Genome Sequences of Five Enterococcus Species Isolated from the Gut of Patients with Suspected Clostridium difficile Infection. Genome Announc. 18;5(20). pii: e00379-17. doi: 10.1128/genomeA.00379-17.

SÁNCHEZ, C., VILLACRECES, J., BLANC, N., ESPINOZA, L., MARTINEZ, C., PASTOR, G., MANQUE, P., UNDURRAGA, S., AND POLANCO, V. (2016) High quality RNA extraction from Maqui Berry for its Application in Next-Generation Sequencing. Springer Plus. 5:1-7. ISSN:2193-1801 (Electronic).Sánchez p. 6

VILLACRESES, J., ROJAS-HERRERA, M., SÁNCHEZ, C., HEWSTONE, N., UNDURRAGA, S.F., ALZATE, J.F., MARACAJA-COUTINHO, V., AND POLANCO, V. (2015) Deep Sequencing Reveals the Complete Genome and Evidence for Transcriptional Activity of the First Virus-Like Sequences Identified in Aristotelia chilensis (Maqui Berry). Viruses.7:1685-1699.

OLMOS, A., HENRÍQUEZ-PISKULICH, P., SÁNCHEZ, C., ROJAS-HERRERA, M., MORENO, M., GÓMEZ, M., RODRÍGUEZ DA SILVA, R., MARACAJA- COUTINHO, V., ALDEA, P. AND TROMBERT, A. (2014) Draft Genome Sequence of Lactobacillus kunkeei strain MP2 isolated from Chilean Apis mellifera gut. Genome Announc. 2:1-2.

POLANCO, V., DÍAZ, M., SÁNCHEZ, C., MERCADO, A., ROJAS, M., RAMÍREZ, I., PRIETO, H. AND PEÑA-CÓRTÉS, H. (2012) Molecular cloning and characterization of a novel 12-oxophytodienoaete reductase 3 from grapevine and its gene expression during wound and Botrytis cinerea infection. ID JPGR-12-0004.

PEÑA-CORTÉS, H., BARRIOS, P., DORTA, F., POLANCO, V., SÁNCHEZ, C., SÁNCHEZ, E. AND RAMÍREZ, I. (2005) Involvement of jasmonic acid and derivatives in plant response to pathogen and insects and in fruit ripening. J. Plant Growth Reg. 23, 246-260.

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